Segundo Trabajo: Hidra

Para el segundo trabajo, Heracles debía matar a la Hidra que habitaba junto a un manantial cerca de Lerna, en la región de Argólida.

La Hidra era una criatura que poseía numerosas cabezas. El número de cabezas variaba según el autor, aunque habitualmente se describían nueve. Una de las cabezas era inmortal. Las demás cabezas eran aún más letales: cuando se cortaba una, dos crecían en su lugar.

Heracles también tuvo que combatir a un cangrejo gigante enviado por Hera. Heracles debió matar al cangrejo antes de poder enfrentarse a la Hidra. Hera recompensó al cangrejo por su servicio colocándolo en una constelación conocida como Cáncer.

Con la ayuda de su sobrino y compañero Yolao (Iolaus, ´Ιολαος), cada vez que Heracles cortaba una de sus cabezas, Yolao utilizaba una antorcha encendida para cauterizar el cuello e impedir que brotaran más cabezas.

La cabeza inmortal fue más fácil de eliminar. Tras cortarla, Heracles la enterró bajo una enorme roca. El veneno de la Hidra era universalmente mortal para cualquier víctima. Heracles untó sus flechas con la sangre de la Hidra. (Este veneno más tarde provocaría su propia muerte.)

Sin embargo, Euristeo se negó a contar este trabajo porque había recibido ayuda de Yolao. Heracles tuvo que realizar un trabajo adicional.